根据《海关法》的有关规定，进出口的货物除国家另有规定外，均应征收关税。关税由海关依照海关进出口税则征收。需要征税费的货物，自接受申报1日内开出税单，并于缴核税单2小时内办结通关手续。
当海关报关系统接收到后会交由审单中心负责处理深圳各个口岸传输的报关数据，目前出口商品绝大多数是由电脑自动审单，只要发送到审单中心，就会自动通过，报关公司在发送前严格审核所申报的资料与客户提供的内容完全一致。审核通过后，打印出口报关单后，连同报关资料(核销单、合同、发票等)，报关员签字、报关公司盖章，向现场海关递单。递单给综合科，综合科在电脑里确认接单，需要征税的货物转给税费组，一般货物转交给风险管理科，风险管理科认为需要查验的货物进行电脑布控，不要查验的货物直接放行，转交给放行组加盖海关印章后出单给报关行。
当海关电脑通过后，打印在空白装船单上，(此时叫做装船单(D/O)，当海关电脑予以放行并且加盖海关印章后，就叫做“放行条”。)报关公司将装船单上的内容(主要是16位数的运输工具号码及10位数的提运单号码)，通过海关允许的录入公司，正式向海关的报关电脑系统申报出口(请注意，海关只承认当海关的电脑报关系统接收到申报时的时间为报关时间，之前这么多环节只算是准备环节，因此海关要求的“提前24小时申报”指的是在某条船截关前的24小时要向海关报关电脑系统申报，当然这个要求不太实际，因为有时路途运输问题、货物生产时间问题、报关资料交接问题等都有可能导致赶船的情况出现，常见的信用证马上到期，货物刚刚好才生产出来，运到码头时当天就要截关。
深圳进出口报关查验，是指海关接受报关单位的申报后，对进出口产品核查，以确认产品性质、状况、数量、价格、原产地等资料和报关单是否相符，其目的是核实单货是否相符、核实是否存在无证进出口、违规、走私、逃漏税等情况和确保关税的征收 另外查验地址为：口岸码头、车站、机场、邮局或其他海关监管地点 查验方法通常为：、抽查、外形查验。
深圳进出口报关关税征收，计算公式为：进口无税价格=(离岸价FOB+运费+保险+杂费)除以1减去保险费率;进口关税-完税价乘以关税税率;关税征收后便是结关放行。
深圳进出口报关申报相关的外贸单证有：一般单证分别有，出口收汇核销单、商业发票、减免税证明书、装备单、运单、包裹单、提单;特殊单证分别有，药检验报告书、动植检、机电产品进口证明、配额许可证、商检、进出口货物许可证;预备单证分别有，授权书、贸易合同、F/A、CO。
深圳进出口报关要经过抽样检验，由进出口商检部门派人主持进行，按照不一样的货物状况，随机抽取样品检验 相关报验员需提供存货具体地址，且配合抽样动作 检验部门可以采用感官、化学分析、仪器分析等多种技术手段，对出口货物进行自检、联检、工厂检验、原产地检验等形式查检。
