目前来看，高新技术服务费有两种主要模式 一、固定金额 即：双方就认定代办一事谈定一个固定的价格和确切的支付条件以及支付时间。使用这种支付方式的一般为老牌的正规机构。 二、比例提佣 即：企业通过认定，拿到相关补贴后。机构按照比例抽取一定的。至于比例，由双方商定。实用此类支付方式的，一般为近几年新成立的机构。因近年高企补贴大幅度提升。催生的新的机构和新的收费模式。
正确核算高新技术产品（服务）收入
按照技术转让合同和其他合同分明细项目进行核算，尽量与所进行的研究开发项目对应，归属哪个项目的收入就列在该项目名下，并且与非高新技术产品 (服务 )区别开。
认定申请应提交的材料主要包括几个部分：
1.认定申请书；
2. 企业营业执照副本、税务登记证（复印件）；
3. 知识产权证书（占许可合同）、生产批文，新产品或新技术（查新）材料、产品质量检验报告、省级以上科技计划立项，以及其他相关材料；
4. 企业职工人数、学历结构以及研发人员占企业职工的比例说明；
5. 经具有资质的中介机构鉴证的企业近三个会计年度研究开发费用情况表（实际年限不足三年的按实际经营年限），并附研究开发活动说明材料；
6. 经具有资质的中介机构鉴证的企业近三个会计年度的财务报表（含资产负债表、损益表、现金流量表，实际年限不足三年的按实际经营年限）以及技术性收入的情况表。
以上材料仅供参考，具体请以实际申请要求为准。
申请要点
1、6个软件著作权或6个实用新型或1个发明。
2、企业需要提供三年内的12份销售合同。
3、企业需要提供近三年内，每年的年度审计报告。近三年的研发费用专项审计报告，高新收入专项审计报告。
4、提供公司人员名单及对应的研发人员、科技人员、人员名单，并提供相应人员的明复印件、劳务合同（岗位及支撑，没有就调整）、明复印件。
5、由技术人员配合调整技术材料，完善立项报告、研发文档等。
