通常，冷藏货物可以分成两种：冷藏和冷冻
许多冷藏货物（例如水果）被视为是“活性（live）”货物，因为其在采摘过后仍然能够进行呼吸并且由于自热、早熟、干燥（萎蔫和枯萎）和其他条件而容易腐烂。然而，其它商品比如冷藏肉/鱼类和奶酪则并非如此。水果的低设定温度通常不低于-1.1℃（30°F）。相反，冷冻货物通常被认为是“惰性(inert)”货物，一般在-18℃（0°F）或更低温度下运载。既然冷藏和冷冻货物都是易腐烂的，就注意确保这类货物以佳状态交付。对于冷藏货物，除了有限的几种例外情况（比如肉，巧克力，胶片，化学物品，奶制品，人工气调储藏运输货物）外，其通风设备通常要保持开启状态。一些货物可能要求湿度控制或者大量的新鲜空气（比如球茎花卉）。应当注意大多数冷冻装置仅能够减少湿度，并且这取决于所提供的新鲜空气的数量。人工气调储藏运输的货物需要使用能够利用氮和二氧化碳替代氧气水平的用途的集装箱，来延长已采摘的产品的保质期。这种方法适用于许多有核和无核水果，但要求具备的知识来确定适宜的气体浓度水平。
关于冷藏集装箱预冷：
（1）一般情况冷藏集装箱不应预冷，因为预冷过的冷藏集装箱一打开门，外界热空气进入冷藏集装箱遇冷将产生水汽凝结，水滴会损坏货物外包装和标签，在蒸发器表面凝结的水滴影响制冷量。但在冷库的温度与冷藏集装箱内温度一致，并采用“冷风通道”装货时，可以预冷集装箱。
(2)预检测试(PTI)：每个冷藏集装箱在交付使用前应对箱体、制冷系统等进行检查，冷藏集装箱清洁、无损坏、制冷系统处于理想状态。经检查合格的冷箱应贴有检查合格标签。
冷藏集装箱装箱前准备工作：根据不同易腐货物应确认下述事项：理想温度设定;新鲜空气换气量设定;相对湿度设定;运输总时间;货物体积;采用的包装材料和包装尺寸;所需的文件和单证等。
装箱前及装货时应注意：设定的温度应正确;设定的新鲜空气换气量应正确;设定的相对湿度应正确;装箱时制冷系统应停止工作;箱内堆装的货物应低于红色装载线和不超出T型槽的垂直面;箱内堆装的货物应牢固、稳妥;箱内堆装货物的总重量应不超过冷箱允许载重量;冷藏集装箱装货后总重量(包括附属设备的重量)在运输途中不应超过任一途经国的限重。
冷藏集装箱出租是指集装箱增加了冷藏功能后对外出租的一种方式，早期很多食品两地运输的距离过长，路上花的时间过久导致变质损坏，慢慢的人们在集装箱里面增加了冷藏功能，这是冷藏集装箱的来源。现在陆运或者海运冷藏集装箱的使用率都很高，已经变成了一种通用的运送工具。
人们常用二手冷藏集装箱运输和保存易腐蚀货物（蛋白质制品或新鲜水果和蔬菜）。在日常使用中，很多人称它为“冻柜”，误认为它跟家用冰箱一样，可以在短时间内完全冷冻货物并长时间保持。实际上，这种认知是错误的，只对了其中一半。
二手冷藏集装箱的冷藏制冷能力有限，主要用于保持货物温度。也是说，人们把-20℃的货物装进去，它能保持货物在-20℃，地运送到目的地；人们把5℃的货物装进去，它能保持货物在5℃下地运送到目的地。如果把常温下（20℃）的货物，直接装箱并要求它冷冻到-20℃，将无法实现。因此，货物在装入二手冷藏集装箱之前需先降温到温度。
