健全内部控制制度 确保研究开发费用核算归集的真实、准确。企业应按月对包括直接研究开发活动和可以计入的间接研究开发活动所发生的费用进行归集，并填写企业年度研究开发费用结构明细表。对研究开发部门的各项费用建立账册，进行单核算。具体来讲应建立如下控制制度 。
建立外包制度 所有研发活动的外包合同经过研究开发项目负责人签署。财务部门依据经过签署的研发活动外包合同和对方提供的有效付款凭证，以及表明经过研究开发项目负责人签署的外包研发活动进展情况的验收确认单据付款，会计人员核对合同和付款单据后记账。研发机构对委托的外部研发投入和境内的外部研发支出在费用单据上进行标注，并经相关负责人审批。财务部门对委托的外部研发投入和境内的外部研发支出分别设立账户核算。所有的外包支付申请说明外包所属的研究开发项目名称、项目编号。财务部门依据研究开发项目名称、项目编号将外包费用计入相应的研究开发项目。
至于申报中需要多少个，说法不一。 总结有两种声音： 种：1个发明或5个实用新型 ； 第二种：15-18个。 认为只需要1个发明或5个实用新型即可申报高企的机构：让客户一下子申报十多个，就是在坑钱。 认为需要15-18个的机构：只拥有1个发明或5个实用新型就去申报，是对政策条件的肤浅认识，是在让客户冒险，看似给客户省钱，实际得不偿失。
