杀菌灭藻剂的使用可以有效改善水体环境和增加水的透明度，不会造成污染现象，为了达到良好的使用效果，在使用时需要足以几个注意问题。
1、将杀菌灭藻剂直接或与水混合后撒入水中。对大量交换水体，可以手工或者使用特殊的定量设备将产品撒入水流入口处，投加可以是连续的，也可以是在经过特殊的活化池处理后加入。
2、使用的时间根据水质参数而确定。为了水环境的改善，对于没有水交换的湖泊，可以集中在一年中的许多时间段内使用；对于有河流、小溪或者其它大量水交换的水体，可以在较长的时间段内稀释使用。
3、水产养殖使用时根据水质污染程度而定使用量。建议使用前和相关技术人员进行沟通，以免使用过程中用量过大而浪费药剂，或者用量过少达不到效果。
根据杀菌灭藻剂种类的化学性能可分为氧化性杀菌剂和非氧化性杀菌剂：
1.氧化性的灭藻剂有着很强的杀伤能力对于水中微生物的杀生作用很强，这种能力有着借助氧化作用杀死微生物。
2.非氧化型杀菌剂则不足以直接杀死微生物，而是以致毒作用的方式将微生物的特殊部位导致，这样一来就能够让微生物死亡，不会像氯（氧化）基那样但会产生毒性物质。
这两种的相反性来说非常大，有着适宜的pH范围广并且能有效地杀灭绝大多数微生物。非氧化性杀菌剂为例，就可以让其离子型化合物的性质，极易溶于水而不溶于非极性溶剂其化学性质稳定哦！
在正确地使用上其杀菌灭藻剂是选择不同的杀菌剂进行复合而成，这样做可以节省成本的损耗、减少加药量并能提高杀菌灭藻效果，降低水处理费用安全和生产。
加药注意事项：
（1）准确、按时、按量进行加药；
（2）采用间断排污时，应在排污之后加药；
（3）每次在配药前，均需将配药桶冲洗干净后，才能将药剂倒入配药桶中，且将药剂加完后均需对配药桶冲洗2~3次；
（4）如采用两种杀菌灭藻剂应交替投加，且加入时间间隔均匀分布；
（5）加入杀菌灭藻剂的当天不投加阻垢缓蚀剂；
（6）详细记录日常加药情况及排污置换情况。
根据系统现状和药剂特性，可将杀菌灭藻剂直接加入集水池中。阻垢缓蚀剂的加药方式为：在循环冷却水集水池旁配置一配药槽，配药槽上部有补水管，下部有排污口，药剂加入配药槽中用补充水稀释后，用计量泵连续均匀地逐渐加入集水池中
