目前来看，高新技术服务费有两种主要模式 一、固定金额 即：双方就认定代办一事谈定一个固定的价格和确切的支付条件以及支付时间。使用这种支付方式的一般为老牌的正规机构。 二、比例提佣 即：企业通过认定，拿到相关补贴后。机构按照比例抽取一定的。至于比例，由双方商定。实用此类支付方式的，一般为近几年新成立的机构。因近年高企补贴大幅度提升。催生的新的机构和新的收费模式。
建立外包制度
所有研发活动的外包合同经过研究开发项目负责人签署。财务部门依据经过签署的研发活动外包合同和对方提供的有效付款凭证，以及表明经过研究开发项目负责人签署的外包研发活动进展情况的验收确认单据付款，会计人员核对合同和付款单据后记账。研发机构对委托的外部研发投入和境内的外部研发支出在费用单据上进行标注，并经相关负责人审批。财务部门对委托的外部研发投入和境内的外部研发支出分别设立账户核算。所有的外包支付申请说明外包所属的研究开发项目名称、项目编号。财务部门依据研究开发项目名称、项目编号将外包费用计入相应的研究开发项目。
国家优惠政策和好处：
1、国家可预计获得深圳各区15万—35万的资金奖励：南山区、宝安区15万；福田区、龙岗区、大鹏新区25万；罗湖区、龙华区、坪山区、盐田区、光明新区35万；
2、可享受国家税收优惠政策、企业所得税减免10%，降幅40%；
3、企业可在此基础上申请其它项目资助，可享受贴息和展会补贴等各项优惠政策。
4、国家资质是金字招牌和无形资产，赢得更多客户合作机会，更多融资并购机会。
国家认定的领域：
一、电子信息 二、生物与新医药 三、航空航天 四、新材料 五、高技术服务 六、新能源及节能 七、资源与环境 八、制造与自动化
