排泥管排泥不均匀时始端会出现积泥时间过长，穿孔管孔眼附近的泥层含水率减少，而排泥的作用水头是有限的，当含水率降低到一定限度，池内水的静压力无法推动孔眼附近的泥层时，孔眼即遭堵塞。并且，随着时间的推移，排泥管会发生孔眼被堵塞的连锁反应，导致沉淀池被迫停产并进行事故修理，不仅增加了维护费用，还会影响水厂的运行。
穿孔管排泥的原理是利用沉淀池有几米深的静水压力对管孔附近的泥产生挤压作用，这些泥在有一定的含水率的情况下具有流动性，当穿泥管的排泥阀开启后，泥水靠水压力进入穿孔管，由孔眼排出池外。
当有大于孔径的异物接近孔眼时，也会形成堵塞，例如自斜管落下的碎片等。径不到穿孔管孔眼直径百分之一，也能将孔眼堵住。因为穿孔管孔眼附近浓缩了泥砂，当含水率很低时，受到上面泥层的压力，相互紧密的挤在一起，形成好像一穿孔管孔径为净跨度的“拱桥”，这时即使穿孔管的排泥阀打开“拱”顶的压力大于“拱”底的压力，这些颗粒不能离开这个被压缩了的泥砂群体进入孔眼，好像一座拱桥，构成拱桥的每一块砖相互压紧，谁也无法离开。
