未经处理的木质因可能会藏有昆虫及虫卵，传入有害生物的风险较高，会打破输入国的生态平衡，导致生 物入侵，可能对农业和森林资源产生严重危害。
USDA颁布了降低木质包装传入有害生物风险的准则。由于 木质包装经常重复利用，真实来源很难确定，因此其处理状况很难确定。
在上面任何一种处理后，在木质包装每件商品的可视位置上，好是在每件商品的正反两面，标上一个清晰和的标记，此标记需要受到国际植物保护公约的认可，以证明木质包装进行了规定的处理。
一个标记包括IPPC标志，ISO标准的国家代码，由该国植物保护机构颁发给木质包装生产商的性的数字，和代表处理方法的字母缩写。熏蒸托盘产品一般符合的入境和环保要求，无需任何手续便可以直接在进口国通关。
消毒方式
有使用药物和热处理两种方式，使用药物为：溴甲烷、环氧乙烷
1、把要熏蒸木箱的货物堆码整齐，用苫布盖好，四边压实，使之密封，但要留出一角做投药口。
2、在苫布下、货物旁放一盆清水，把药投入水中
3、把预留的投药口压实，使需要熏蒸木箱的货物处于完全密封状态下保持24小时
4、打开苫布通风，待毒气散尽即可移动货物，大概18－24小时
5. 开出免熏蒸木箱（消毒）证书。
主要有两种处理方法：热处理和用溴甲烷熏蒸。对于热处理，木质包装处理时，其木材中心温度应达到56℃，并且至少保持30分钟，对于熏蒸，木质包装在密闭地方，于规定的溴甲烷剂量下熏蒸至少16小时，然后置于通风处，使其熏蒸剂的浓度降到安全浓度以下。在上面任何一种处理后，在木质包装每件商品的可视位置上，好是在每件商品的正反两面，标上一个清晰和的标记，此标记需要受到国际植物保护公约的认可，以证明木质包装进行了规定的处理。一个标记包括IPPC标志，ISO标准的国家代码，由该国植物保护机构颁发给木质包装生产商的性的数字，和代表处理方法的字母缩写。熏蒸托盘产品一般符合的入境和环保要求，无需任何手续便可以直接在进口国通关。
