在制冷制热切换方面，风冷机组是冷媒环路通过四通阀切换流动方向。将冷凝器和蒸发器互换。夏季热量从室内传递到室外，冬季则从室外吸热到室内。而水冷机组不具备蒸发器和冷凝器互换能力，所以接冷却塔的机组没有制热的功能（需要外接锅炉）。热泵式机组要切换冷冻水和冷却水环路，在机房内要增加8个水路切换阀门。夏季冷水进屋，热水进外部盘管。冬季热水进屋，冷水进外部盘管。
风冷式机组虽然在节约用水、简化系统及节约安装空间等方面具有显著优点，但从整个空调建设工程综合考虑上，包括土建费用、冷却水和冷冻水系统费用、电控和配套管理费及运行费用等，与水冷式冷水机组相比，风冷式冷水机组还不显优势。目前，绝大部分空调工程的主机选配，还是以水冷式冷水机组为主。
在冷水机组中，高压表所指示的压力称作冷凝压力，该压力所对应的温度称为冷凝温度。冷凝温度的高低，在蒸发温度不变的情况下，对于机组功率消耗有决定意义。冷凝温度升高功耗增大，此外，离心式制冷机组冷凝压力升高会引起主机喘振。反之，冷凝温度降低，功耗随之降低。因此，在冷水机组运行操作时，应注意冷却水温度、水量、水质等指标在合格范围。空气存在于冷凝器中时，冷凝温度与冷却水出口温差增大，而冷却水进、出口温差反为减少，这时冷凝器的传热效果不好，冷凝器外器有烫手感。除此之外，冷凝器管子水侧结垢和淤泥对热量传达的影响也起着相当的作用。
润滑油系统是机组正常运行不可缺少的部分，它为机组的运动零件提供润滑和冷却条件。从各种机组的润滑系统组成特点看，除往复式机组将润滑油储存在压缩机曲轴内依附于制冷系统外，离心式和螺杆式机组都有立的润滑油系统，有自己的贮油容器，有用于降低油温的油冷却器。因此，润滑油的油压差，油温与油压高度，是机组在正常工作条件下，运动零件润滑和冷却的三要素。
冷水机组电解法能抑制水垢的附着，但是除垢不，且具有电解孔蚀的危险;早期应用的磁力法稳定性比较差，长时间使用不能控制积垢，定期清扫积聚在控制器中的氧化铁;而静电法则克服了上述诸方法的缺点，并且，除了防垢和溶垢外，还有显著的杀菌灭藻的效能。但是静电法和电子水处理法冷水机缓蚀作用较的化学缓蚀略低，在一般空调冷却水系统内可不考虑采用其它缓蚀方法。而在一些对缓蚀要求较高的冷水机系统好同时适量添加一些缓蚀剂，可获得更好效果。
安装环境与位置会引起噪音问题,如果工业冷水机处于比较狭小的环境中，则噪音会被“放大”。狭小的环境会让工业冷水机的正常运行声音变大，听上去会超过正常运行的声音，建议不管是风冷机还是水冷机，一律安装在较为空阔的环境中，并且周边没有杂物异物，对环境声音有较高要求的话，可安装隔音墙，并保持通风散热。
