在使用冷藏集装箱的时候如果是长距离运输，那么箱内的温度差不能超过3度，这样才可以箱内的温度保持在一个恒温的状态。如果是运输新鲜的水果或者是蔬菜，那么要及时打开新风口，可以进行通气。
冷藏集装箱是一种能保持设定温度的保温容器，主要运输冷冻食品。它是为运输鱼、肉、新鲜水果和蔬菜等食物而设计的。目前，国际上使用的冷藏集装箱基本上有两种：一种是机械冷藏集装箱，集装箱内装有冰箱；另一种容器没有冰箱，只有隔热结构，即在容器的端壁上有进气口和孔。箱体安装在机舱内，冷风由船舶制冷装置提供。这种集装箱称为离合器式冷藏集装箱（也称为外部或夹紧式冷藏集装箱）。
冷藏集装箱温度记录：
数据记录仪监测冷藏货舱的送风和回风温度，该数据存在电子存储器中。该存储器也记录预检结果和报警情况，以及一系列与控制器和电力装置的数据交流情况。这些数据可直接下载到电脑中，进而可进行打印，存储或者作为邮件附件形式发出。如果数据记录仪能够记录“开始行程”信息，该信息应当包括货物的来源地及其目的地。同时应检查确认其日期和时间信息是否准确。
