要搞好本品种选育应注意以下问题。
，进行品种普查。摸清品种的分布、数量、质量、产区的自然条件、经济条件，该品种的特征与特性，主要优缺点等。
第二，明确选育目标，制定选育计划，确定选育的性状。
第三，建立选育基地，组建选育核心群，公马不应少于10匹，母马按1：5的公母比例选留。
第四，严格选种选配，健全马籍、系谱、性能测定资料等。
第五，科学饲养，合理培育。
另一种选配是异质选配，即选择具有不同性状的公母马交配，以期将两个性状结合在一起，从而获得兼有双亲不同优点的后代，或者选择同一性状但优劣程度不同的公母马交配，以良好的性状纠正不良性状，使后代获得较大改进和提高。例如：用、公马与二级、三级母马交配。但不能用凸腰的公马与凹腰的母马交配。
即根据交配双方的亲缘关系进行交配，可分为近交和远交，如亲子、祖孙、叔侄，全同胞间交配叫近交，远堂兄妹之间交配叫远交。近交既能巩固个体的有益性状，也会使近交后代生活力下降，适应性变差，繁殖力降低。因此，慎重地、巧妙地应用。对于马驴的选配，无论采用哪种方法，都要考虑配偶双方的年龄。凡是青年和年龄的个体都要选择壮龄的配偶，而青年或老龄公母之间不能交配。
