阳离子交换树脂运行主要是吸附离子，所以使用一段时间后会接近饱和树脂。这个时候如果不再生的话，那么树脂就不能再吸附，也就“没用”了。这个时候会进行再生操作。将化学药剂将阳离子交换树脂吸附的离子和杂质洗脱除去。
当树脂上的大量功能基团与钙镁离子结合后，树脂的软化能力下降，可以用氢化纳溶液流过树脂，此时溶液中的钠离子含量高，功能基团会释放出钙镁离子而与钠离子结合，这样树脂就恢复了交换能力，这个过程叫作“再生”。阳离子交换树脂的再生方式离子交换剂失效后通过再生来恢复离子交换能力，常用再生方式有顺流再生与逆流再生。
阳离子交换树脂,软化树脂,树脂顺流再生时原水与再生液流过交换剂层的方向相同。因此在再生液流过交换剂层时接触到的是交换剂层上部完全失效的已包含上部交换剂层被置换出来的离子，影响交换剂层下部的再主度(再生度指离子交换剂层中已再生离子量与全部交换容量的比值)，造成处理水质降低、再生剂耗量增加。顺流再生离子交换设备简单，工作可靠，但受原水水质组分影响大，再生效果换容量不能得到充分利用。而再生后，下部再生度低，为了提高出水质量和工作交换容量，增加再生剂的耗量。
与顺流再生比较，采用逆流再生提高了再生剂利用率，降低再生剂耗量30%-50%提高出水质量;降低清洗水耗量30%~50%降低再生废液排放量与排放浓度，排放再生废液中酸、碱浓度小于1%。采用逆流再生原水含盐量500mg/L时，仍能保持出水质量;由丁辱部交换剂再生，增口交换剂工作层，同时原水先接触上部未再生交换剂，减少了反离子效应，提高了交换剂工作交换容量。
离子交换是可逆的，离子交换剂失效后理论上再生1 mol离子量需要再生剂的摩尔量称为再生比耗(或称再生水平)，以纯度再生剂表示。也可用实际再生剂的消耗量与理论需要量的比值来表示，如强碱阴树脂需要纯度NaOH的再生比耗为1.5，即实际再生lmol离子量需要的NaOH量1.5×40是60g(1molNaOH是40g)，也可以说强碱阴树脂需要纯度NaOH的再生比耗(再生水平)为60g/mol。再生比耗与进水水质、树脂质量、再生方式等因数有关。阳离子交换树脂再生，其再生剂量应是设计再生剂量的1.5~2倍，逆流再生设备在大反洗后的再生剂量要增加10%-50%。
再生液流速涉及再生液和树脂的接触时间，直接影响再生效果。在离子交换器中，再生液的流速一般控制在4 ~8m/h。如果再生液和树脂的接触时间不够，可调整再生液的浓度和流速，必要时修改设备直径。强型阳离子交换树脂的再生浓度一般采用2%-5%，弱型阳离子交换树脂容易再生，对再生效率影响不大，再生浓度一般采用0.5%一5%。强碱性阴阳离子交换树脂的再生流速=2~4，再生时间与运行时进水中的Si02%有关。
