各门类古生物化石的具体鉴定方法不尽相同，但一般都要经过下述步骤：
①
熟悉标本外部形态和内部构造，对大化石的细微构造或微体化石，一般需要借助实体镜、显微镜或电子显微镜进行观察。有时要将化石做连续切片,以便于了解其内部构造特征;
②
利用所具有的知识并查阅有关文献,确定较大的分类阶元,一般定到科；
③
利用检索表、图版等文献资料， 将标本进一步检索到属、种；
④
选择有代表性的种群标本或典型的单个标本进行特征描记，度量各种性状要素及照相。
由于种以种群为单位生活，其中存在着连续的个体变异。然而模式标本往往只是某个物种发现的标本，不一定全面地反映该种的特征。在这个概念指导下，没有一个个体是种群性状的“典型”。在鉴定物种时，要尽可能多地、全面地采集标本，使得这些标本能大体反映真正种群的总面貌，然后，用各种统计方法来区分种间变异和种群内变异，从而达到鉴定物种的目的。
一个科学名称仅指体的单一类型，这样全世界的科学家都能明白。分类的基本单位是种，一个种中的全部成员基本上都很相似，且相互能够进行杂交。一个或多个种组合在一起，由他们共有的特点相互连接，构成一种属。属由科(一组属)和目(一组科)组成一个体的谱系图或家族树。种以下的名称均是人为的分类，并随各时期的意见的改变而不断地改变。
