庭院种菜、阳台种菜和楼顶种菜主要的问题是肥料问题，人们都不情愿使用化学肥料，选择合适的自制肥料是一个很伤脑筋的问题。有人说，利用大豆制作有机肥成本太高，但是却忽略了一个核心问题，那就是在自己家里种植的蔬菜是自己吃的，能吃上安全的蔬菜才是重中之重，况且用量不大，成本也不是太高。
大豆发酵有机肥的有效方法：
将大豆直接埋进土壤、煮熟以后埋进土壤或者粉碎以后施入土壤作为花肥或者种菜都会产生烧根、烧苗等不良现象，也只有充分腐熟以后才能使用，这是种菜养花者明白的事情。
大豆腐熟的方法：
1.配制营养液。将上述三种方法进行初处理的大豆放进容器里，加水3倍以上，然后加入适量的红糖水或者EM菌，再加入适量的橘子皮、柠檬皮或者橙子皮，以减轻异味，容器多容纳水溶液的量为80%。做完这一切以后，将容器进行密封，然后放在阳光充足的地方进行暴晒，利用高温加速发酵速度。
在30℃以上的环境，经过7天就能完全腐熟。如果温度较低，可能需要1-2个月才能腐熟。如果不加红糖水或者EM菌，腐熟时间一般在2个月以上。如果不加入果皮，腐熟过程和腐熟以后会散发大量的臭味，不适宜家庭种菜种花。
腐熟以后的大豆水，需要再次稀释10-50倍以后再浇花浇菜，避免浓度太高而烧苗。
堆肥。将初处理的大豆加水，加水量一般为大豆重量的65-70%，然后加入适量的红糖水或者EM菌，橘子皮、柠檬皮或者橙子皮，放进容器内拌匀，然后盖上一次麦糠、稻壳等进行保湿，然后放在温度较高的地方进行堆沤。
当堆肥开始发热，就需要注意，当温度上升到65-70℃时，将容器内的大豆进行搅拌，然后补充水分，让含水量达到65%左右。经过2-3次翻堆，不在发热的时候，说明已经完全发酵。发酵时间一般在7天以上，外界温度越高，发酵速度越快。
腐熟以后的大豆堆肥可以作为基肥，也可以穴施，肥效很高，需要注意远离根系和使用量。
混合其他材料进行腐熟。每个家庭都会有各种垃圾，其中包括剩饭剩菜、泔水、烂菜叶、菜根、骨头、动物内脏、瓜子皮、花生壳、茶叶渣、室内垃圾、庭院落叶等，也有豆浆渣、腐烂的水果、过期的食品和饮料等，都是制作有机肥的原料，将这些原料与粗加工的大豆进行混合，再加入红糖水、橘子皮等进行堆沤，经过一段时间就可以腐熟了。腐熟以后一般作为底肥，也可以在生育期内根部追肥。
大豆发酵的注意事项
1.如果温度较高，发酵时间可以超过十天；如果温度低，时间会长一点。
2.由于物质需要在瓶中发酵，因此不能装得太满。它可以是80%或90%满的；没有必要把瓶口拧得太紧，留下空隙。
3.发酵大豆肥料和水在使用时应适当稀释。大豆发酵相对容易生产出可以在家里生产的肥料。准备好的水和肥料可以用来浇花。
