在食品厂净化车间的布局上，每个生产环节的合理衔接与加工过程的卫生控制需要双重把关。一般情况下，车间内需要对人员、物料动线明确规定，避免操作过程中发生交叉污染。此外，在每个净化区操作间都应设置气闸室与各操作间连通，使得低净化区的空气不向高净化区渗透，便于卫生控制。
食品厂净化车间的通风空气净化设备需要应用的送风/回风/排风系统，不断的循环和提供新风和排出净化车间内受污染空气。若采用机械通风时，换气量应大于3次/小时；若采用自然通风，那么通风的面积与车间地面面积之比不能小于1：16，用以达到生产环境所需的洁净度。
食品厂净化车间一般作业区(非清洁区)一般的原料、成品、工具储存区域，包装成品转运区域等原料、成品外露风险较低的区域，如外包装室、原辅料仓库、包装材料仓库、外包装车间、成品仓库等。
对于清洁作业区根据国家《食品生产许可审查通则》规范，建议食品烘培车间洁净度达到10万级(30万级对目前食品保质期越来越短的趋势已经不够用了)，个别区域可根据要求调整即可。
食品厂净化车间建筑内部结构应易于维护、清洁或消du。应采用适当的材料建造。顶棚应使用无du、无味、与生产需求相适应、易于观察清洁状况的材料建造，若直接在屋顶内层喷涂涂料作为顶棚，应使用无du、无味、防霉、不易脱落、易于清洁的涂料。
食品厂净化车间的好坏会影响生产效率：一方面，优良的环境不仅可以保障生产加工人员的身心健康，而且可以提高他们的工作心情和工作激情；另一方面，优良的环境可以确保生产的顺利开展，提升产品的合格率。
可以肯定的是，要控制一般车间所有室内微环境中悬浮颗粒物的浓度，使其达到生产工艺标准的清洁度水平，几乎是不可能的。只有建立洁净室，采用密闭空间结构，合理配风，合理压差，才能达到微环要求的空气洁净度水平，满足生产需要。因此，食品行业在生产时是离不开洁净室食品厂净化车间使用的!
