冷凝锅炉的工作原理主要基于的冷凝热回收装置，这种装置能够吸收锅炉排出的高温烟气中的潜热或水蒸气凝结所释放的潜热，从而显著提高锅炉的热效率。
在冷凝锅炉中，燃烧产生的烟气温度较低，通常在50至70摄氏度之间，这使得烟气中的部分水蒸气冷凝成液态，释放出大量的凝结潜热，这部分潜热被回收利用，显著提高了锅炉的热效率。与传统锅炉相比，冷凝锅炉的热效率可以高达109%，远超传统锅炉的85%至91%。
此外，冷凝锅炉还具有环保优势，由于烟气冷凝，可以减少酸性物质和其他污染物的排放，从而降低对环境的影响。
正面影响
燃料燃烧会产生大量的CO2、NOX和少量的SO2，这些物质排放到大气，会引起温室效应和酸雨的产生，对环境产生破坏作用。冷凝锅炉在冷凝烟气中水蒸汽的同时，可以方便地去除烟气中的这些有害物质，因此，采用冷凝锅炉对保护环境也具有重要的意义。
负面影响
由于冷凝的作用排烟温度过低，如果低于临界点会产生冷凝水，从而产生酸性排放物，对锅炉换热体产生腐蚀，因此要控制排烟温度。
图解烟气冷凝式热水器效率超过的原理性错误
E=A+B+C
η1=(D+B)/E
η2=D/A
(1)热力学第二定律认为，E=A+B+C，因此，η1=(A+B)/E，η1≤。
(2)锅炉热效率，针对不使用烟气热能这一简化计算条件，将锅炉B=0，保温条件良好时忽略热损失C=0，锅炉热效率可简化估算为η2=D/A，故简化计算式的应用限定条件为“不使用烟气热能”。
(3)冷凝式采暖设备，其特征是“使用烟气热能”，故不能采用η2=D/A进行计算。
(4)在保温条件良好时忽略热损失C=0，冷凝式采暖设备的热效率计算应为η1=(D+B)/E，可简化为η1=(D+B)/(A+B)，而不是η1=(D+B)/A。
如果，在冷凝式采暖设备的热效率计算中错误地选用导出的传统锅炉热效率估算公式，而不是使用热力学第二定律的热效率定义式，就会出现热效率大于的离谱现象。
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