F－46树脂和聚四氟乙丙烯一样，也是完全氟化的结构，不同的是聚四氟乙烯主链的部分氟原子被三氟甲基（－CF3）所取代，结构式如下：
由此可见，F－46树脂和聚四氟乙烯虽都由碳氟元素组成，碳链周围完全被氟原子包围着，但F－46其大分子的主链上有分支和侧链。这种结构上的差别对于材料在长期应力下的温度范围上限来看，无很大影响，F－46的上限温度为200℃，而聚四氟乙烯的高使用温度是260℃。但是，这种结构上的差别，却使F－46树脂具有相当确定的熔点，并可用一般的热塑性加工方法成型加工，使加工工艺大为简化。这是聚四氟乙烯所不具备的。这便是用六氟丙烯改性聚四氟乙烯的主要目的。
F－46中六氟丙烯的含量对共聚体的性能是有一定的影响。当前生产的F－46树脂的六氟丙烯的含量，通常在14%－25%（质量分数）左右。
物理性能
F－46树脂的分子量测定，当前尚无可行的方法。但它在380℃时的熔融粘度要比聚四氟乙烯低，为103－104Pa．s。可见F－46的分子量比聚四氟乙烯低得多。
F－46的熔点随共聚体的组分不同而有一定的差异，共聚体中六氟丙烯的含量的增加时，熔点变低。按差热分析法所测得的结果，国产F－46树脂的熔点大多在250－270℃之间，比聚四氟乙烯低。
F－46树脂是一种结晶性高聚物，结晶度比聚四氟乙烯低一些，当F－46熔体缓慢冷却到晶体熔点以下温度时，大分子重行结晶，结晶度在50%－60%之间；当熔体以淬火方式迅速冷却时，结晶度较小，在40%－50%之间。F－46的晶体结构形态，均为球晶结构，并随树脂和加工成型温度及热处理方式的不同而有一定的差异。
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