SEM+EDS可以用于分析水体中的悬浮物、污染物等物质的微观结构和化学成分，研究其来源、扩散和生物毒性等。例如，对于水体中的重金属离子，可以通过SEM观察其形貌和分布情况，通过EDS分析其元素种类和含量，探究其对水生生物和人类健康的潜在影响。
SEM+EDS可以用于研究环境污染物质对生物体（如鱼类、昆虫等）的毒害作用及其机制。通过观察生物体在不同污染环境下的形貌变化和元素分布情况，可以深入探究环境污染物质对生物体的毒害作用及其与环境因素的相互作用。
SEM可以用于观察化石和古生物标本的表面形貌和内部结构，如恐龙、猛犸象等。EDS可以用于分析古生物标本中的元素组成，有助于了解古生物的食性、生活环境和演化历程。
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