通常，冷藏货物可以分成两种：冷藏和冷冻
许多冷藏货物（例如水果）被视为是“活性（live）”货物，因为其在采摘过后仍然能够进行呼吸并且由于自热、早熟、干燥（萎蔫和枯萎）和其他条件而容易腐烂。然而，其它商品比如冷藏肉/鱼类和奶酪则并非如此。水果的低设定温度通常不低于-1.1℃（30°F）。相反，冷冻货物通常被认为是“惰性(inert)”货物，一般在-18℃（0°F）或更低温度下运载。既然冷藏和冷冻货物都是易腐烂的，就注意确保这类货物以佳状态交付。对于冷藏货物，除了有限的几种例外情况（比如肉，巧克力，胶片，化学物品，奶制品，人工气调储藏运输货物）外，其通风设备通常要保持开启状态。一些货物可能要求湿度控制或者大量的新鲜空气（比如球茎花卉）。应当注意大多数冷冻装置仅能够减少湿度，并且这取决于所提供的新鲜空气的数量。人工气调储藏运输的货物需要使用能够利用氮和二氧化碳替代氧气水平的用途的集装箱，来延长已采摘的产品的保质期。这种方法适用于许多有核和无核水果，但要求具备的知识来确定适宜的气体浓度水平。
冷藏集装箱的货物检查，在装箱之前应对冷藏水果和蔬菜的温度以及冷冻货物的中心温度进行检测。还应检查水果和蔬菜是否存在比如发霉、枯萎、脱水、萎蔫、褪色、软点、破皮和脱皮、擦伤、冻伤和发臭等冷藏前的损坏。对于冷冻货物还应检查其是否有脱水、干燥、移位、发臭、黑斑和颜色改变，以及是否有因温度升高解冻后又重新冷冻的迹象。还应检查纸箱、托盘和其他包装物状况是否良好，是否能够在整个海运过程中保护货物状况。
冷藏集装箱脱离制冷时间：各种运输方式之间的交接可能出现短途运输或制冷系统故障，造成停止制冷。对冷冻和冷藏保鲜货物短时间地停止制冷状态是允许的。许多产品出现几小时的停止制冷可以接受，但并非所有货物都如此。对任何冷藏货物均不允许出现长时间地停止制冷。对特种货物和温度灵敏货物应保持制冷系统连续工作，避免任何温度波动造成货物质量下降。
关于冷藏集装箱预冷：
（1）一般情况冷藏集装箱不应预冷，因为预冷过的冷藏集装箱一打开门，外界热空气进入冷藏集装箱遇冷将产生水汽凝结，水滴会损坏货物外包装和标签，在蒸发器表面凝结的水滴影响制冷量。但在冷库的温度与冷藏集装箱内温度一致，并采用“冷风通道”装货时，可以预冷集装箱。
(2)预检测试(PTI)：每个冷藏集装箱在交付使用前应对箱体、制冷系统等进行检查，冷藏集装箱清洁、无损坏、制冷系统处于理想状态。经检查合格的冷箱应贴有检查合格标签。
冷藏集装箱装箱前准备工作：根据不同易腐货物应确认下述事项：理想温度设定;新鲜空气换气量设定;相对湿度设定;运输总时间;货物体积;采用的包装材料和包装尺寸;所需的文件和单证等。
装箱前及装货时应注意：设定的温度应正确;设定的新鲜空气换气量应正确;设定的相对湿度应正确;装箱时制冷系统应停止工作;箱内堆装的货物应低于红色装载线和不超出T型槽的垂直面;箱内堆装的货物应牢固、稳妥;箱内堆装货物的总重量应不超过冷箱允许载重量;冷藏集装箱装货后总重量(包括附属设备的重量)在运输途中不应超过任一途经国的限重。
冷藏集装箱装货注意事项
(1)冷冻集装箱在装货过程中，在检查冷冻装置，确认冷冻机已停止运转;
(2)货物预冷：在装货前，要对冷冻集装箱内使用的垫木和其他衬垫材料要预冷，并要对货物应进行预冷处理，并预冷到运输要求的温度，因冷箱设计制冷能力有限，仅能用于保持货物的温度。如果货物温度过高，将使制冷系统超负荷工作，导致该系统出现故障，影响货物运输。
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