在一定的环境条件下，微生物通过代谢活动对饲料原料中的某些物质进行分解和转化，使原料中不易被牲畜和家禽利用的大分子物质转变成为易于消化吸收的小分子物质，同时，微生物得到增殖，由于微生物菌体的单细胞蛋白含量很高，因而提高了成品饲料的蛋白质含量，这就是广义的微生物蛋白饲料。另外若微生物菌种群中含有对牲畜和家禽具有益生功能的饲用微生物，则微生物蛋白饲料就会具有更好的饲喂效果。
微生物发酵饲料中营养成分高，提高了养分利用率，适口性好。含有多种有益微生物，如霉菌、酵母菌及细菌的一些类群，可补充有益菌，调节动物的微生态平衡，增强了猪只的力，使猪只健康程度提高，减少了用药成本，消除排泄物臭味等方面。解决抗生素残留和环境污染等问题，还能调整农业产业结构，实现能源综合利用，促进农业的可持续发展。
我国饲用蛋白质资源匮乏以及非粮蛋白质资源利用率偏低，制约了畜牧业现代化进程，主要蛋白质饲料原料豆粕等长期依赖进口，成为制约我国饲料工业和畜牧业发展的瓶颈，随着我国蛋白饲料原料进口量的不断提高，蛋白饲料原料创新保障畜牧养殖业健康发展成为养殖业重要挑战，寻找和开发新的蛋白质资源成为饲料工业急需解决的问题，且伴随着饲料行业的迅速发展，饲料也逐渐向低药、低残留的趋势发展，生物发酵蛋白饲料的发展呈现一片生机，微生物发酵蛋白饲料能够使饲料中的大分子物质和营养物质分解转化为易消化、吸收和利用的小分子物质、小肽等，可溶性蛋白的增加，增加了蛋白的消化利用率，有效降解抗营养因子，提高了蛋白饲料的营养水平和利用效率，也间接增加了蛋白供给，缓解了蛋白饲料原料的供应不足，提高动物的生产性能。
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