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荔枝根系因苗木繁殖方法不同而异。实生树及嫁接树有发达的主根;高压(圈枝)繁殖的荔枝侧根须根发达,没有主根。荔枝的根系由很多粗壮发达的侧根和纤细茂密的细根所组成,初生的幼根白色,肉质,质脆易断,俗称“豆芽根”。
枝梢的叶芽和花芽均是单芽,且裸露,但顶芽有雏叶包围保护。枝梢优势强,顶芽容易萌发成枝;腋芽,强枝者只有1~2个能萌发,其余均为潜伏芽。新梢老熟后有的枯死,由侧芽变成顶芽。
荔枝花穗抽出至开花前的孕蕾期长短与多种因素有关,但以冬春(1~3月)的气温影响大,一般为30~40天,而开花期的长短则与品种、气候、花穗抽生早迟等有关,短的仅15天,长的可达86天,荔枝树的开花有如下特性。